常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法
常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法:細(xì)胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細(xì)菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細(xì)胞污染,真菌污染來源,一般是來自實(shí)驗(yàn)服,并且具有氣候性,多雨······
發(fā)布時(shí)間:2025-05-07 17:32:04 細(xì)胞資源庫平臺 訪問量:35
英文標(biāo)題:SOX4 facilitates brown fat development and maintenance through EBF2-mediated thermogenic gene program in mice
中文標(biāo)題:SOX4通過EBF2介導(dǎo)的產(chǎn)熱基因程序促進(jìn)小鼠棕色脂肪的發(fā)育和維持
發(fā)表期刊:《Cell death and differentiation》
影響因子:13.7
作者單位:
細(xì)胞應(yīng)激生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,細(xì)胞信號網(wǎng)絡(luò)創(chuàng)新中心,教育部分子診斷工程研究中心
廈門大學(xué)附屬第一醫(yī)院廈門心血管病研究所心臟電生理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
廈門大學(xué)醫(yī)學(xué)院健康與醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)國家研究所
中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院
作者信息:
Shuai Wang;Ting He;Ya Luo;Kexin Ren;Huanming Shen;Lingfeng Hou;Yixin Wei;Tong Fu;Wenlong Xie;Peng Wang;Jie Hu;Yu Zhu;Zhengrong Huang;Qiyuan Li;Weihua Li;Huiling Guo;Boan Li
棕色脂肪的研究
大量研究表明,代謝活躍的棕色脂肪存在于嬰兒和成人中,并且人類BAT活動的增加與體重下降相關(guān)。因此,促進(jìn)BAT的發(fā)展和功能可能是對抗肥胖及相關(guān)代謝紊亂的一種有前途的策略。
棕色脂肪的調(diào)控因子
幾種轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子已被證明參與了BAT的發(fā)展和功能。先前的譜系研究表明,經(jīng)典的棕色脂肪細(xì)胞來源于在胚胎發(fā)育過程中表達(dá)En1、Pax3、Pax7和Myf5的多能祖細(xì)胞。在BAT發(fā)育過程中,這些祖細(xì)胞發(fā)展為前脂肪細(xì)胞,隨后通過轉(zhuǎn)錄級聯(lián)分化為棕色脂肪細(xì)胞。早期B細(xì)胞因子2(EBF2)是棕色脂肪細(xì)胞命運(yùn)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子。它能夠招募過氧化物酶體增殖物激活受體-γ(PPARγ),這是一種在脂肪細(xì)胞分化過程中關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子,到其棕色特異性結(jié)合位點(diǎn),以維持BAT身份。去除對EBF2的抑制作用可以增強(qiáng)白色脂肪細(xì)胞的產(chǎn)熱潛力。最近的研究表明,EBF2增強(qiáng)了ERRα/PGC1α復(fù)合物的轉(zhuǎn)錄活性,以促進(jìn)產(chǎn)熱基因的表達(dá)并維持BAT的核心溫度。這些發(fā)現(xiàn)表明EBF2對于棕色脂肪細(xì)胞分化和產(chǎn)熱功能至關(guān)重要。然而,EBF2的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子仍然未知。
SOX4的作用
SRY相關(guān)高遷移率組盒轉(zhuǎn)錄因子4(SOX4)是Sox C家族的一員,包含高遷移率組DNA結(jié)合域(HMG-Box域)和C端轉(zhuǎn)錄激活域(TAD域)。它在調(diào)節(jié)細(xì)胞干性、細(xì)胞分化以及神經(jīng)系統(tǒng)、內(nèi)分泌島和心臟的發(fā)育中起關(guān)鍵作用。我們發(fā)現(xiàn)SOX4不僅抑制WAT中的前脂肪細(xì)胞決定,而且在長期寒冷暴露期間作為PPARγ的共激活因子促進(jìn)米色脂肪細(xì)胞的形成。
SOX4與棕色脂肪
盡管棕色和米色脂肪分化的調(diào)控涉及一組重疊的泛脂肪生成和BAT特異性轉(zhuǎn)錄在現(xiàn)有研究中,SOX4在決定棕色脂肪細(xì)胞命運(yùn)中的潛在作用尚不明確。我們發(fā)現(xiàn),SOX4通過促進(jìn)Ebf2的轉(zhuǎn)錄,對小鼠的褐色脂肪組織發(fā)育和產(chǎn)熱功能至關(guān)重要,這一過程可能受到PKA激活的促進(jìn)。
研究意義
我們的研究揭示了SOX4在調(diào)控產(chǎn)熱基因程序中的調(diào)節(jié)作用和機(jī)制,并表明靶向SOX4可能是對抗肥胖以提高能量消耗的一種潛在策略。
實(shí)驗(yàn)動物與飼養(yǎng)條件
小鼠種類為C57BL/6遺傳背景的雄性,在22–24°C溫度、50–60%濕度、12小時(shí)光照/黑暗周期下群居籠中飼養(yǎng)。
飲食條件
小鼠分別接受含67.4%碳水化合物、20.6%蛋白質(zhì)、12%脂肪的普通飲食,或含20%碳水化合物、20%蛋白質(zhì)、60%脂肪的高脂飲食。
免疫組化和免疫熒光
使用HE染色、免疫熒光和免疫組化技術(shù)對小鼠組織進(jìn)行染色和觀察,以研究特定蛋白的表達(dá)和定位。
透射電子顯微鏡
通過透射電子顯微鏡技術(shù)觀察小鼠BAT組織的超微結(jié)構(gòu)。
身體成分分析
使用Echo MRI組成分析儀評估小鼠的脂肪和瘦肉質(zhì)量。
紅外熱成像和耐寒測試(CTT)
通過紅外熱成像和耐寒測試來評估小鼠的體溫調(diào)節(jié)能力。
基因表達(dá)分析
使用定量PCR和RNA-Seq技術(shù)分析小鼠組織中基因的表達(dá)水平。
細(xì)胞培養(yǎng)與脂肪細(xì)胞分化
在體外培養(yǎng)小鼠BAT前脂肪細(xì)胞,并通過特定培養(yǎng)基誘導(dǎo)其分化為成熟的棕色脂肪細(xì)胞。
油紅O染色和甘油三酯測量
通過油紅O染色觀察細(xì)胞內(nèi)脂滴的形成,并測量甘油三酯水平以評估脂肪細(xì)胞的脂肪積累。
棕色脂肪細(xì)胞氧消耗率(OCR)測定
使用XF96 Extracellular Flux Analyzer測定分化后的棕色脂肪細(xì)胞的氧消耗率,以評估其代謝活性。
腺病毒的構(gòu)建、純化和注射
構(gòu)建并純化攜帶Sox4基因的腺病毒,并將其注射到小鼠BAT中以實(shí)現(xiàn)SOX4的過表達(dá)。
腺相關(guān)病毒(AAV)的包裝和純化
構(gòu)建并純化攜帶SOX4基因的腺相關(guān)病毒,通過尾靜脈注射到小鼠體內(nèi)以實(shí)現(xiàn)SOX4的過表達(dá)。
熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)
構(gòu)建熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒,通過轉(zhuǎn)染細(xì)胞和測定熒光素酶活性來研究基因啟動子的活性。
染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)和ChIP測序分析
通過ChIP技術(shù)結(jié)合高通量測序分析SOX4蛋白在基因組中的結(jié)合位點(diǎn)。
Sox4-MKO小鼠構(gòu)建:通過Myf5-Cre小鼠與Sox4f/f小鼠交配,特異性地在BAT中敲除Sox4基因。
SOX4蛋白水平降低:Sox4-MKO小鼠的BAT、iWAT和gWAT中SOX4蛋白水平顯著降低。
BAT形態(tài)學(xué)改變:Sox4-MKO小鼠的BAT組織形態(tài)發(fā)生改變,脂滴大小顯著減小。
胚胎BAT發(fā)育異常:E15.5 Sox4-MKO胚胎的肩胛間BAT區(qū)域發(fā)育異常,SOX4和UCP1表達(dá)降低。
ob/ob小鼠BAT變化:ob/ob小鼠BAT中SOX4和UCP1蛋白及mRNA水平均降低。
飲食影響B(tài)AT:高脂飲食喂養(yǎng)的小鼠BAT中SOX4和UCP1表達(dá)降低。
年齡影響B(tài)AT:隨著年齡增長,小鼠BAT中SOX4和UCP1表達(dá)降低。
Sox4-MKO新生鼠產(chǎn)熱不足:Sox4-MKO新生鼠在冷暴露下皮膚溫度降低,表明產(chǎn)熱能力受損。
Sox4-MKO成鼠體溫調(diào)節(jié)受損:Sox4-MKO成鼠在冷暴露后核心體溫下降,血糖和血清游離脂肪酸水平升高,BAT中甘油三酯含量降低。
Sox4-MKO成鼠能量代謝降低:Sox4-MKO成鼠在冷暴露下氧消耗和熱量產(chǎn)生降低,對β3-腎上腺素能受體激動劑的反應(yīng)減弱。
Sox4-BKO新生鼠產(chǎn)熱不足:Sox4-BKO新生鼠在冷暴露下皮膚溫度降低,表明產(chǎn)熱能力受損。
Sox4-BKO成鼠體溫調(diào)節(jié)受損:Sox4-BKO成鼠在冷暴露后核心體溫下降,血糖和血清游離脂肪酸水平升高,BAT中甘油三酯含量降低。
Sox4-BKO成鼠能量代謝降低:Sox4-BKO成鼠在冷暴露下氧消耗和熱量產(chǎn)生降低。
Sox4-MKO小鼠對高脂飲食更易感:Sox4-MKO小鼠在高脂飲食喂養(yǎng)下體重增加更多,顯示出對肥胖的易感性。
葡萄糖耐量受損:Sox4-MKO小鼠在葡萄糖耐量測試中血糖水平更高,表明葡萄糖代謝受損。
胰島素耐量受損:Sox4-MKO小鼠在胰島素耐量測試中血糖水平更高,表明胰島素敏感性降低。
脂肪質(zhì)量和分布改變:Sox4-MKO小鼠的脂肪質(zhì)量和瘦肉質(zhì)量比例改變,BAT、iWAT、gWAT和肝臟的重量與體重比例增加。
脂肪組織形態(tài)學(xué)改變:Sox4-MKO小鼠的脂肪組織顯示脂滴增大,炎癥標(biāo)記物F4/80表達(dá)增加。
代謝活動降低:Sox4-MKO小鼠的食物攝入量、運(yùn)動活動、氧消耗和產(chǎn)熱均降低,表明整體代謝活動下降。
Sox4-MKO小鼠BAT超微結(jié)構(gòu)改變:透射電子顯微鏡顯示Sox4-MKO小鼠的BAT中線粒體數(shù)量減少,脂滴增大。
線粒體蛋白表達(dá)降低:免疫熒光和qPCR分析顯示Sox4-MKO小鼠BAT中TOM20和線粒體DNA的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)降低。
RNA測序揭示基因表達(dá)變化:RNA測序和熱圖分析顯示Sox4-MKO小鼠BAT中大量基因表達(dá)下調(diào),包括線粒體功能和脂肪代謝相關(guān)基因。
線粒體功能基因表達(dá)降低:RT-PCR分析顯示Sox4-MKO小鼠BAT中線粒體復(fù)合物基因表達(dá)降低。
BAT特異性基因表達(dá)降低:RT-PCR分析顯示Sox4-MKO小鼠BAT中多個(gè)BAT特異性基因表達(dá)降低。
蛋白水平降低:Western blot分析顯示Sox4-MKO小鼠BAT中SOX4、線粒體呼吸鏈成分、BAT特異性蛋白和AGT蛋白的表達(dá)降低。
Sox4在棕色脂肪細(xì)胞分化中的必要性:通過慢病毒介導(dǎo)的shRNA技術(shù),在體外抑制Sox4表達(dá),發(fā)現(xiàn)Sox4對于棕色脂肪細(xì)胞的分化是必需的。
Sox4缺失影響脂肪積累:Sox4缺失導(dǎo)致分化后的棕色脂肪細(xì)胞中脂滴減少,甘油三酯含量降低。
BAT特異性基因表達(dá)降低:Sox4缺失導(dǎo)致棕色脂肪細(xì)胞中BAT特異性基因的mRNA水平顯著降低。
WAT特異性基因表達(dá)增加:Sox4缺失導(dǎo)致棕色脂肪細(xì)胞中WAT特異性基因的mRNA水平增加。
蛋白水平降低:Sox4缺失導(dǎo)致棕色脂肪細(xì)胞中BAT富集蛋白和AGT蛋白的表達(dá)降低。
線粒體數(shù)量減少:Sox4缺失導(dǎo)致棕色脂肪細(xì)胞中線粒體DNA的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)降低。
氧消耗率降低:Sox4缺失導(dǎo)致棕色脂肪細(xì)胞的氧消耗率降低,表明其代謝活性下降。
RNA測序與基因本體分析:RNA測序數(shù)據(jù)顯示Sox4-MKO和Ebf2-AKO BAT中重疊下調(diào)基因,基因本體分析揭示與BAT發(fā)育相關(guān)基因顯著下調(diào)。
ChIP測序結(jié)果:ChIP測序顯示SOX4在Ebf2啟動子上游-4k處顯著富集結(jié)合,表明直接調(diào)控關(guān)系。
ChIP分析:ChIP分析證實(shí)SOX4蛋白在BAT SVF中Ebf2啟動子上游-4k處有顯著占用。
螢光素酶活性實(shí)驗(yàn):NIH3T3細(xì)胞中,SOX4轉(zhuǎn)染顯著增強(qiáng)野生型pGL4.26-EBF2載體的螢光素酶活性,突變載體無此效應(yīng)。
Ebf2啟動子轉(zhuǎn)錄活性:NIH3T3細(xì)胞中,SOX4顯著提高Ebf2啟動子的相對轉(zhuǎn)錄活性,ΔHMG和ΔTAD突變體活性降低。
FAIRE實(shí)驗(yàn):BAT SVF細(xì)胞感染shSOX4慢病毒后,Ebf2啟動子區(qū)域的染色質(zhì)開放性降低。
免疫熒光分析:E15.5 Sox4f/f和Sox4-MKO胚胎中,Sox4-MKO胚胎的EBF2表達(dá)顯著降低。
UMAP圖:E10.5到E13.5小鼠胚胎間充質(zhì)和骨骼肌細(xì)胞的UMAP圖顯示BAT發(fā)育區(qū)域的細(xì)胞簇。
發(fā)育階段細(xì)胞突出顯示:UMAP圖中根據(jù)發(fā)育階段起源突出顯示細(xì)胞。
Sox4和Ebf2表達(dá)模式:不同細(xì)胞簇中Sox4和Ebf2的表達(dá)模式顯示其相關(guān)性。
平均表達(dá)水平:E10.5到E13.5小鼠胚胎中Ebf2和Sox4的平均表達(dá)水平顯示其協(xié)同變化。
人類iPSCs分化表達(dá):人類iPSCs分化為棕色脂肪細(xì)胞過程中,Sox4和Ebf2的mRNA表達(dá)水平同步變化。
免疫染色實(shí)驗(yàn):BAT SVF細(xì)胞在不同培養(yǎng)基中處理1小時(shí)后,免疫染色顯示SOX4的核定位變化。
ChIP-Seq分析:對照組和3X HA-SOX4表達(dá)的BAT SVF細(xì)胞在不同培養(yǎng)基中處理,ChIP-Seq分析顯示SOX4在Ebf2啟動子上的結(jié)合模式及新發(fā)基序。
免疫熒光實(shí)驗(yàn):BAT SVF細(xì)胞經(jīng)不同處理(DMSO、佛司可林、H89)后,佛司可林刺激顯示SOX4蛋白核轉(zhuǎn)位增強(qiáng)。
ChIP-qPCR:未處理或佛司可林處理的BAT SVF中,SOX4在Ebf2啟動子上的占有率顯著增加。
RT-qPCR分析:Sox4-MKO和對照小鼠的BAT SVF細(xì)胞經(jīng)佛司可林處理后,Ebf2 mRNA水平顯著變化。
冷暴露實(shí)驗(yàn):Sox4f/f和Sox4-MKO小鼠在冷暴露后,BAT中Ebf2的表達(dá)水平顯著不同。
螢火蟲報(bào)告基因?qū)嶒?yàn):不同處理的BAT SVF細(xì)胞中,Ebf2增強(qiáng)子的轉(zhuǎn)錄活性顯著變化。
質(zhì)譜分析:HEK293T細(xì)胞共轉(zhuǎn)染W(wǎng)T-PRKACA或KD-PRKACA與HA-SOX4,質(zhì)譜分析顯示SOX4磷酸化位點(diǎn)。
氨基酸殘基比對:不同物種SOX4殘基S325及其相鄰氨基酸殘基的比對。
免疫熒光實(shí)驗(yàn):NIH3T3細(xì)胞轉(zhuǎn)染Flag-SOX4(WT或S235A突變體),佛司可林處理后SOX4核轉(zhuǎn)位變化。
qPCR分析:NIH3T3細(xì)胞轉(zhuǎn)染Flag-SOX4(WT或S235A突變體),佛司可林處理后Ebf2 mRNA水平變化。
機(jī)制圖解:佛司可林誘導(dǎo)PKA激活,SOX4在S235處磷酸化,核轉(zhuǎn)位后與EBF2合作激活EBF2轉(zhuǎn)錄。
免疫熒光分析:SOX4和EBF2在成熟BAT脂肪細(xì)胞核中共定位,提示功能相互作用。
免疫沉淀和Western blot分析:抗SOX4抗體免疫沉淀驗(yàn)證了SOX4與EBF2的物理結(jié)合。
ChIP實(shí)驗(yàn):SOX4在Ucp1和Prdm16基因啟動子區(qū)域顯著占有率,表明直接轉(zhuǎn)錄調(diào)控。
FAIRE實(shí)驗(yàn):Sox4-BKO小鼠在Ucp1和Prdm16啟動子上游區(qū)域的DNA富集減少,影響染色質(zhì)開放狀態(tài)。
轉(zhuǎn)錄活性評估:SOX4和EBF2共同過表達(dá)顯著增強(qiáng)Ucp1和Prdm16啟動子的轉(zhuǎn)錄活性。
示意圖模型:冷刺激或福司可林激活PKA,磷酸化SOX4促進(jìn)核定位,與EBF2協(xié)同增強(qiáng)產(chǎn)熱基因轉(zhuǎn)錄。
1. SOX4對BAT發(fā)育和產(chǎn)熱的重要性
SOX4是BAT發(fā)育和產(chǎn)熱程序的必需因子。
Sox4-MKO和Sox4-BKO小鼠在冷暴露時(shí)出現(xiàn)BAT變白和體溫過低。
2. Sox4-MKO小鼠的產(chǎn)熱能力降低
Sox4-MKO小鼠產(chǎn)熱能力下降,易受飲食誘導(dǎo)的肥胖影響。
3. SOX4過表達(dá)增強(qiáng)產(chǎn)熱
BAT中過表達(dá)SOX4可增強(qiáng)產(chǎn)熱,對抗飲食誘導(dǎo)的肥胖。
4. SOX4通過激活EBF2轉(zhuǎn)錄調(diào)控棕色脂肪命運(yùn)
SOX4通過激活EBF2的轉(zhuǎn)錄決定棕色脂肪細(xì)胞的命運(yùn)。
5. PKA磷酸化SOX4促進(jìn)核內(nèi)轉(zhuǎn)移和EBF2轉(zhuǎn)錄
PKA在S235位點(diǎn)磷酸化SOX4,促進(jìn)其核轉(zhuǎn)位和EBF2的轉(zhuǎn)錄。
6. SOX4與EBF2合作激活產(chǎn)熱基因轉(zhuǎn)錄程序
SOX4與EBF2共同激活調(diào)控產(chǎn)熱基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄程序。
常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法:細(xì)胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細(xì)菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細(xì)胞污染,真菌污染來源,一般是來自實(shí)驗(yàn)服,并且具有氣候性,多雨······
細(xì)胞聚團(tuán)的原因分析及如何避免:培養(yǎng)物中細(xì)胞可能聚集的一些原因包括:1.過度消化、2.環(huán)境壓力、3.組織分解、4.過度生長、5.污染等;如何避免聚團(tuán)細(xì)胞的生成;首先確認(rèn)當(dāng)前細(xì)胞生長密度及狀態(tài),80%左右的生長密度即可進(jìn)行······
細(xì)胞有空泡原因分析及解決方法:出現(xiàn)細(xì)胞空泡情況有1.細(xì)胞老化2.培養(yǎng)液錯(cuò)誤配制;3.細(xì)胞消化時(shí)操作不當(dāng);4.污染等等,如細(xì)胞老化,解決方法,原代細(xì)胞使用較低代次進(jìn)行實(shí)驗(yàn),傳代細(xì)胞避免傳代次數(shù)過高···
細(xì)胞半換液和全換液操作步驟:第一種方式:細(xì)胞全換液;如果是貼壁細(xì)胞,可以用全量換液法,直接吸去全部舊培養(yǎng)基,補(bǔ)充足量新鮮完全培養(yǎng)基;第二種方式:細(xì)胞半換液;"細(xì)胞半換液"又稱"細(xì)胞半量換液",即棄掉一半舊的培養(yǎng)基,再······
細(xì)胞生長緩慢的可能原因有哪些:細(xì)胞培養(yǎng)外部因素包括細(xì)胞培養(yǎng)基的配方和質(zhì)量問題,培養(yǎng)條件不理想,污染問題,細(xì)胞自身因素包含細(xì)胞的健康狀態(tài),細(xì)胞密度過高或過低,細(xì)胞老化現(xiàn)象,細(xì)胞特性,當(dāng)細(xì)胞生長出現(xiàn)緩慢的問題時(shí),我······
常用胰腺癌細(xì)胞株動物模型及胰腺癌細(xì)胞株有哪些:胰腺癌研究中常用的動物模型主要包括化學(xué)物質(zhì)誘導(dǎo)胰腺癌動物模型,基因工程胰腺癌小鼠模型和胰腺癌移植模型,常用的胰腺細(xì)胞株MIA-PACA-2人胰腺癌細(xì)胞,Capan-2人胰腺癌細(xì)······
產(chǎn)品規(guī)格:1*10^6
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